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Ribo-seq应用：肿瘤免疫与抗原发现
在新抗原发现和免疫治疗靶点鉴定中，传统方法常从基因组突变入手：先找到突变，再预测可能的抗原肽。但预测出的抗原肽不一定真的被翻译出来，更不等于能被MHC（主要组织相容性复合体）呈递并被T细胞识别。 Ribo-seq（核糖体印迹测序）像给细胞里的蛋白质生产线拍快照，它检测mRNA上正在被核糖体读取的区域，从而推断哪些序列正在被翻译成多肽（短蛋白）。它尤其能帮助判断，过去在传统注释中不被视为蛋白编码区域的非编码区（如lncRNA、UTR）或非传统开放阅读框（nuORF）是否真的在制造多肽。这些多肽若被加工成小片段，并成功结合到MHC分子上呈递给T细胞，就可能成为新抗原候选，有望为TCR-T等识别肽-MHC的免疫治疗提供新的靶点来源。
2026-11-09
Ribo-seq应用：5'‑UTR 隐藏的翻译刹车--保守 uORF 调控新生儿癫痫的相关基因KCNQ2
目前，很多单基因病是因为基因杂合功能缺失、蛋白表达不足导致的。例如新生儿癫痫，主要的特征是神经元异常、过度的放电，这与编码一种电压依赖性钾通道（KV 7.2）的KCNQ2基因相关。该通道可以降低神经元兴奋性，防止神经元过度、反复发放动作电位，维持神经网络兴奋性平衡。然而，目前治疗的药物只能抑制神经元放电，不能从根源上解决 KCNQ2 蛋白表达不足的问题，给许多家庭带来了沉重的负担。
2026-11-05
PNAS丨Ribo-seq应用：古菌病毒如何 “劫持” 宿主？Ribo-seq 揭开一场特殊的微生物博弈
病毒捕食是驱动微生物进化、塑造地球生物地球化学循环的重要力量。相较于细菌与噬菌体、真核生物与真核病毒之间的大量研究，古菌（archaea）作为一类既存在于极端生境、也广泛分布在土壤海洋的生命类群，它们与古菌病毒（archaeal virus）之间的分子互作，仍然是领域的缺口。
2026-09-23
PNAS丨Ribo-seq应用：一边救援、一边判 “死刑”？eIF5A 与多胺协同把控核糖体停滞的命运抉择
在蛋白质翻译过程中，核糖体并非一直顺畅完成肽链合成。当 mRNA 上出现稀有密码子、多碱性氨基酸序列或者 RNA 损伤时，核糖体就会发生翻译停滞。如果停滞的核糖体得不到处理，一方面会持续合成毒性截短多肽，另一方面会占用核糖体资源，给细胞带来巨大的蛋白组压力。
2026-09-16
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