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做三代转录组(PacBio Iso-Seq/ONT cDNA...
09-15
如何基于蛋白质的序列寻找同源结构
当一个蛋白结构和功能未知时,我们可以基于蛋白质的序列去挖掘一...
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使用MEGA11构建进化树主要包括以下步骤:数据准备、序列比...
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PNAS丨Ribo-seq应用:古菌病毒如何 “劫持” 宿主?Ribo-seq 揭开一场特殊的微生物博弈
病毒捕食是驱动微生物进化、塑造地球生物地球化学循环的重要力量。相较于细菌与噬菌体、真核生物与真核病毒之间的大量研究,古菌(archaea)作为一类既存在于极端生...
09-23
PNAS丨Ribo-seq应用:一边救援、一边判 “死刑”?eIF5A 与多胺协同把控核糖体停滞的命运抉择
在蛋白质翻译过程中,核糖体并非一直顺畅完成肽链合成。当 mRNA 上出现稀有密码子、多碱性氨基酸序列或者 RNA 损伤时,核糖体就会发生翻译停滞。如果停滞的核糖...
09-16
PNAS丨Ribo-seq应用:核糖体停滞、A 位点状态、核糖体间距共同决定植物 mRNA 翻译与共翻译降解命运
核糖体沿着 mRNA 翻译蛋白并不是一路畅通无阻。当翻译受阻,核糖体发生停滞(ribosome stalling),后续核糖体接踵而上,遇见前面停下的核糖体,就...
09-14