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三代测序全长转录组,生信分析软件到底怎么选?
做三代转录组(PacBio Iso-Seq/ONT cDNA...
09-15
如何基于蛋白质的序列寻找同源结构
当一个蛋白结构和功能未知时,我们可以基于蛋白质的序列去挖掘一...
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如何利用MEGA11构建系统进化树?
使用MEGA11构建进化树主要包括以下步骤:数据准备、序列比...
07-15
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Ribo-seq应用:肿瘤免疫与抗原发现
在新抗原发现和免疫治疗靶点鉴定中,传统方法常从基因组突变入手:先找到突变,再预测可能的抗原肽。但预测出的抗原肽不一定真的被翻译出来,更不等于能被MHC(主要组织...
11-09
Ribo-seq应用:5'‑UTR 隐藏的翻译刹车--保守 uORF 调控新生儿癫痫的相关基因KCNQ2
目前,很多单基因病是因为基因杂合功能缺失、蛋白表达不足导致的。例如新生儿癫痫,主要的特征是神经元异常、过度的放电,这与编码一种电压依赖性钾通道(KV 7.2)的...
11-05
PNAS丨Ribo-seq应用:古菌病毒如何 “劫持” 宿主?Ribo-seq 揭开一场特殊的微生物博弈
病毒捕食是驱动微生物进化、塑造地球生物地球化学循环的重要力量。相较于细菌与噬菌体、真核生物与真核病毒之间的大量研究,古菌(archaea)作为一类既存在于极端生...
09-23